有機(jī)肥菌種，即生物有機(jī)肥的菌種，把有機(jī)固體廢物（包括有機(jī)垃圾、秸稈、畜禽糞便、淤泥、糟渣、餅粕、農(nóng)副產(chǎn)品和食品加工產(chǎn)生的固體廢物）經(jīng)發(fā)酵、除臭和完全腐熟后加工而成的有機(jī)肥料。

生物有機(jī)肥的種類：農(nóng)家肥：堆肥，沼渣等。
商品生物有機(jī)肥：商品化生產(chǎn)的生物有機(jī)肥。即農(nóng)家肥商品化生產(chǎn)后的產(chǎn)物。

微生物有機(jī)肥：用微生物菌劑做功能菌的生物有機(jī)肥，如菌堅(jiān)強(qiáng)菌種復(fù)配的有機(jī)肥.