不同種類的有機肥料應單獨存放在倉庫內，并貼上標簽，標明名稱和化學成分。不得將其堆放在一起。硫酸銨、硝酸氫銨、氯化銨、氨等銨類有機肥在遇到植物灰、石灰、石灰氮等堿性肥料時，易引起氮揮發(fā)，降低肥料利用率；當硝酸銨、硝酸鈉和其他硝酸鹽有機肥料與過磷酸鈣混合時，肥料會潮解，導致硝酸鹽有機肥料逐漸分解，變成氣體并流失，造成不應有的損失。

有機肥應貯存在倉庫內干燥處，防水防潮。有機肥料通常溶于水。受水分或水分影響，極易結塊或變成液體而流失，嚴重影響肥效。硝酸銨、碳酸氫銨等肥料吸濕性強，易潮解；硫酸銨、氯化銨、尿素等肥料在吸濕后會形成硬塊，不僅降低了肥料的肥效，而且給應用帶來困難。

儲存期間，小心不要損壞包裝袋。不要將其堆放在室外，讓其被風吹走，被雪覆蓋并暴露在陽光下。室內還應墊木，距地面0.3米以上，同一種有機肥不宜堆放過高。

有機肥料應低溫儲存，避光。氮肥怕熱，不能與易燃易爆物質混合使用。

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