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有機堆肥的發(fā)酵過程簡單可分為以下4各階段
1、有機堆肥發(fā)熱階段
堆肥制作初期，堆肥中的微生物以中溫、好氣性的種類為主，常見的是芽孢桿菌和霉菌。它們啟動堆肥的發(fā)酵過程，在好氣性條件下旺盛分解易分解有機物質（如簡單糖類、淀粉、蛋白質等），產(chǎn)生大量的熱，不斷提高堆肥溫度，從20℃左右上升至40℃，稱為發(fā)熱階段，或中溫階段。
2、有機堆肥高溫階段
隨著溫度的提高，好熱性的微生物逐漸取代中溫性的種類而起主導作用，溫度持續(xù)上升，一般在幾天之內即達50℃以上，進入高溫階段。
在高溫階段，好熱放線菌和好熱真菌成為主要種類。它們對堆肥中復雜的有機物質（如纖維素、半纖維素、果膠物質等）進行強烈分解，熱量積累，堆肥溫度上升至60-70℃，甚至可高達80℃。隨即大多數(shù)好熱性微生物也大量死亡或進入休眠狀態(tài)（20天以上），這對加快堆肥的腐熟有很重要的作用。堆肥不當?shù)亩逊?，只有很短的高溫期，或者根本達不到高溫，因而腐熟很慢，在半年或者更長時期內還達不到半腐熟狀態(tài)。
3、有機堆肥降溫階段
當高溫階段持續(xù)一定時間后，纖維素、半纖維素、果膠物質大部分已被分解，剩下很難分解的復雜成分（如木質素）和新形成的腐殖質，微生物的活動減弱，溫度逐漸下降。當溫度下降到40℃以下時，中溫性微生物又成為優(yōu)勢種類。
如果降溫階段來的早，表明堆制條件不夠理想，植物性物質分解不充分。這時可以翻堆，將堆積材料拌勻，使之產(chǎn)生第二次發(fā)熱、升溫，以促進堆肥的腐熟。
4、腐熟保肥階段
堆肥腐熟后，體積縮小，堆溫下降至稍高于氣溫，這時應將堆肥壓緊，造成厭氣狀態(tài)，使有機質礦化作用減弱，以利于保肥。
簡而言之，有機堆肥的發(fā)酵過程實際上就是各種微生物新陳代謝、繁殖的過程。微生物的新陳代謝過程即有機物分解的過程。有機物分解必然會產(chǎn)生能量，這些能量推動了堆肥化進程，使溫度升高，同時還可干燥濕基質。
一般來說，自然條件下，有機堆肥發(fā)酵過程15-20天可達到堆肥的無害化處理標準，45-60天才能完全發(fā)酵。人元生物公司研制的RW有機肥發(fā)酵菌劑為高科技微生物產(chǎn)品，由細菌、放線菌、絲狀菌、酵母菌等多種菌株及相關酶類復配而成，好氧發(fā)酵，分解纖維素、分解蛋白質能力很強，同時能夠迅速達到升溫、除臭、除病蟲害、雜草種子和富集養(yǎng)分的效果。不但縮短了有機堆肥的發(fā)酵時間，還大大提高了有機堆肥的發(fā)酵效果，增加了有機質，這使得有機堆肥的利用率大幅提高。
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